飛凡檢測: | 細胞鑒定 |
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所在地: | 江蘇 蘇州 吳江 |
有效期至: | 長期有效 |
發(fā)布時間: | 2023-12-17 11:20 |
最后更新: | 2023-12-17 11:20 |
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飛凡檢測張同學(xué)今天與大家淺聊一下STR,首先什么是STR呢?
STR即短串聯(lián)重復(fù)序列(Short Tandem Repeats),也稱微衛(wèi)星DNA(microsatellite DNA),是一段包含1-6bp的重復(fù)DNA序列。STR廣泛存在于原核動物和真核動物中,人類中也不例外,約占人類基因組的3%。由于其多態(tài)性和高突變率,STR在生物學(xué)研究中得到了廣泛的應(yīng)用,又被稱為細胞的DNA指紋。
由于STR技術(shù)的高靈敏度、自動化程度高、準(zhǔn)確快速、重復(fù)性好等優(yōu)點,STR基因分型已被作為金標(biāo)準(zhǔn)應(yīng)用于細胞鑒定,由于細胞系交叉污染或錯誤辨識而導(dǎo)致研究錯誤、結(jié)果不可重復(fù)等情況的存在,因此建議在實驗開展前進行細胞的STR鑒定分析。
細胞STR鑒定即通過STR信息建立細胞系的遺傳特性,通過STR鑒定來檢測細胞是否發(fā)生交叉污染或者誤認的情況。STR 基因座位上的等位基因可通過擴增區(qū)域內(nèi)重復(fù)序列拷貝數(shù)的不同來區(qū)分,在毛細管電泳分離之后可通過熒光檢測來識別。隨后通過一定的計算方法,即可根據(jù)所得的STR分型結(jié)果與細胞STR數(shù)據(jù)庫比對,從而推算出樣品所屬的細胞系或可能的交叉污染的細胞系名稱。
STR(Short Tandem Repeat,短串聯(lián)重復(fù)序列)基因位點由長度為3~7個堿基對的短串連重復(fù)序列組成,這些重復(fù)序列廣泛存在于人類基因組中,可作為高度多態(tài)性標(biāo)記,被稱為細胞的DNA指紋。 STR基因座位上的等位基因可通過PCR擴增區(qū)域內(nèi)重復(fù)序列的拷貝數(shù)的不同來區(qū)分,在毛細管電泳分離之后可通過熒光檢測來識別,隨后通過一定的計算方法,即可根據(jù)所得的STR分型結(jié)果與專業(yè)的細胞STR數(shù)據(jù)庫比對從而推算出樣品所屬的細胞系或可能的交叉污染的細胞系名稱。那么STR的鑒定結(jié)果能說明什么呢? STR的鑒定結(jié)果能證明以下問題: 1. 是否為人源細胞;2. 是否為標(biāo)準(zhǔn)細胞系;3. 是否存在物種內(nèi)交叉污染。為什么要進行STR鑒定?據(jù)統(tǒng)計,約18%~30%細胞系被交叉污染或錯誤辨識,使用該細胞可能導(dǎo)致研究結(jié)論錯誤、結(jié)果不可重復(fù)、臨床細胞治療災(zāi)難性后果等。 2009年起,NIH和ATCC呼吁研究者對細胞進行STR鑒定并著手建立細胞STR數(shù)據(jù)庫。如今,細胞STR鑒定已是鑒別細胞身份及交叉污染的金標(biāo)準(zhǔn)。多數(shù)**期刊也要求作者投稿時提供細胞STR鑒定證明?!吨袊幍洹分忻鞔_規(guī)定,新建細胞系/株、細胞庫和生產(chǎn)終末細胞應(yīng)進行鑒別試驗,以確認為本細胞,且無其他細胞的交叉污染。